北部湾大学由钦州学院升格改名而来，学校前身为钦州地区师范学校，始建于1973年。1982年设立钦州地区教师进修学院。1988年更名为钦州地区教育学院，1991年改建为钦州师范高等专科学校。2004年，合并创建于1906年的钦州民族师范学校（含广西广播电视大学钦州分校）的钦州师范高等专科学校，组建新的钦州师范高等专科学校。2006年升格为钦州学院。2018年11月底，教育部批准在钦州学院基础上设立北部湾大学。