四川科技职业学院设有土木与建筑工程学院、建筑设计与设计艺术学院、航空旅游与高铁学院、互联网+学院、药品与健康管理学院、经济管理学院、创业管理学院、财经学院、电商学院、通识教育学院、体育学院、汽车工程学院、工业自动化学院、节能环保学院、一带一路工程学院、国际教育学院共计16个二级学院，包括43个专业。